这一系列的文章源于edx上PH525这一系列课程,从实用角度出发分为四部分:

  • 原始数据读取与数据结构
  • 高维数据的分组差异比较
  • 基因组数据建模与可视化
  • 结果注释与通路分析

其实就是按工作流程走的,首先设计实验,跑芯片,然后拿到机器读数。根据厂家不同,原始数据的处理方式也不同,我们采用基于R的bioconductor来进行分析。为此我们需要知道基因组数据的读取方法及在bioconductor中的数据结构。之后就是按照我们的科学问题进行差异比较,这里面会遇到 …